食用菌最常见和危害较严重的杂菌主要有木霉、链孢霉、毛霉、曲霉、青霉、细菌等20多种。臭氧发生器对以上菌类均有极强的杀灭效果。现主要介绍危害最为严重的下列三类菌类：
1、木霉
木霉俗称绿霉。几乎能为害所有的食用菌，其对食用菌的为害表现为：（1）污染培养料与食用菌争夺营养和空间；（2）分泌霉素杀伤、杀死寄主；（3）木霉菌丝接触到寄主菌丝时将寄主菌丝缠绕切断。
2、链孢霉
链孢霉俗称红粉病，红面包霉病，为食用菌生产中常见杂菌，可污染所有的食用菌，是一种顽强、速生的气生霉菌，培养料受污染后，还在料面迅速形成橙红色或粉红的霉层。
3、曲霉与青霉
曲霉俗称黄霉、绿霉、黑霉等。曲霉的种类很多。黑曲霉的菌落为黑色疏松的果粒状；黄曲霉黄色、黄绿色，最后呈褐绿色；灰绿曲霉初白色后呈灰绿色；青霉，其种类多、菌落呈灰绿色、黄绿色或蓝色粉状霉层。曲霉、青霉均属常见的杂菌，它们与食用菌争夺营养、水分，并分泌霉素抑制食用菌生产。
利用臭氧发生器对食用菌的生长空间进行空气消毒，可以有效的杀灭以上菌类。另外用臭氧发生器对含有以上菌类的水进行消毒，杀菌效果更为彻底。有关实践证明，灭菌率达到99%。现在，越要越多的养殖户利用臭氧发生器对食用菌生产车间进行杀菌、消毒处理，都收到了良好的经济效益。
臭氧作为一种广谱高效杀菌剂，其杀菌速度较氯快300-600倍，可以快速杀灭各种细菌繁殖体和芽孢，病毒和真菌，如：
1、寄生性真菌病害：有褐腐病、褐斑病、软腐病、褶霉病、枯萎病、浅红酵母病等。
2、竞争性真菌病害：毛霉，根霉，曲霉，青霉，链孢霉，绿霉。
特别是对黑木耳栽培菌制菌期危害最为严重的“红色脉孢霉（Neurosporspp）”杀菌效果极佳。
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