目前食品企业最常用车间的清洁消毒产品是75度的酒精，臭氧，紫外灯，二氧化氯，还有的企业甚至还在继续使用甲醛。了解并合理的运用相关的消毒产品，更有利于食品企业微生物超标控制。
酒精优点：无色无味，挥发性快；但是醇类弱消毒剂，对于凹凸面的穿透力不强；对病毒、芽孢的杀灭率低；易燃易爆，不易大面积车间喷洒；成本高，不安全。
紫外灯利用其产生的紫外线辐射进行物体表面和空气的消毒灭菌，操作简单，价格便宜，管理方便，不添加产生有毒有害物质；
缺点：紫外线强度，随着使用时间的增加而减弱，因而消毒杀菌能力不断减弱。
2、紫外线穿透力弱，仅能杀灭直接照射到的微生物，容易被生产设备阻挡出现死角，影响杀菌效果。 受湿度的影响较大，相对湿度>80%时，不宜使用。 紫外线照射物体表面距离不宜>1.50m，紫外灯开机不能有人上班时使用
二氧化氯杀灭范围广，对细菌、真菌、病毒、芽孢、艾滋、乙肝等都有很好的抑制和杀灭效果；不受温湿度、PH值等因素影响；可根据不同对象来稀释成不同使用浓度；缺点：有刺鼻性气味；有活化的环节。
甲醛对车间空气消毒作用时间长，影响生产。如甲醛熏蒸：消毒时间12h，静置4 h，排风8h，消毒一次最少需要24 h。消毒一次要停产2~5天。需要设置排风系统或设施，易产生二次污染。有强烈的刺激性气味，去除残留气味时间长，对生产操作人员身体有害，有致癌作用。
